Krátce po zdánlivé porážce temného archona Ulrezaje na protosském domovském světě Aiuru se Jake a Rosemary při útěku opravenou warpovou branou rozdělují. Rosemary
spolu s ostatními uprchlíky dorazí na Shakuras, zatímco Jake je odkloněn jinam. Ale Jakeovi už nezbývá mnoho času, jejich nepřátelé se přeskupují a Zamařina esence musí
být z Jakeovy mysli odstraněna dřív, než bude příliš pozdě.

Poháněný živými vzpomínkami dávno mrtvé protosské opatrovatelky a pronásledovaný nenasytnými zergy Královny čepelí, vydává se archeolog Jake Ramsey na nebezpečnou výpravu na legendární domovský svět protossů Aiur. Hledá tam životně důležitou protosskou technologii, Aiur však nachází obsazený zergy. Přesto musí sestoupit do stínového labyrintu pod povrchem a nalézt tam posvátný krystal dřív, než mu vyprší čas – jemu i celému vesmíru. To, co Jake objeví pod povrchem Aiuru, však překoná i jeho nejdivočejší noční můry. V jeskyních se skrývá Ulrezaj – archon sestávající se ze sedmi nejsmrtonosnějších a nejmocnějších temných templářů v historii.

Talentovaný archeolog s nepříliš světlými vyhlídkami do budoucna – Jake Ramsey – dostal šanci svého života. Najali ho, aby prozkoumal nedávno objevený chrám Xel’Nagů. Jake ví, že mu tento úkol otevře úplně nové možnosti. Veškeré jeho sny a tužby se však ztratí v záplavě mimozemských vzpomínek, když najde tělo protosské věštkyně. Jakmile se jeho duše spojí s duší mrtvého protosse, stane se Jake jediným, kdo zná celou historii protossů – každou událost, každou myšlenku a každý pocit.
V jeho mysli zuří bouře, při snaze zachránit aspoň část své vlastní osobnosti si však uvědomí jednu věc. Narazil na tajemství, jehož podstata je tak hrozná, že otřese samotnými základy vesmíru.